特等奖!深大学子问鼎挑战杯!
祝贺!
深大学子斩获
“挑战杯”国赛特等奖!
无挑战,不青春
他们在赛场的精彩表现
展现出深大学子锐意进取
昂扬向上的精神风貌
10月27日至31日,由共青团中央、中国科学技术协会、教育部、中国社会科学院、中华全国学生联合会和贵州省人民政府共同主办,贵州大学承办的第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛终审决赛于贵州大学隆重举行。
本届“挑战杯”吸引了全国2000多所高校、250多万学生参赛,涌现出40余万优秀作品。经过校级、省级、全国三级比赛,我校项目《数字细菌》入围终审决赛,与全国300多所高校超700件科技作品进行激烈角逐,最终斩获特等奖!
数字细菌团队成员在布展
数字细菌展位实况
团队路演答辩入场前合影
辛勤磨一剑
梅花香自来
艰难困苦,玉汝于成
一件好的作品离不开背后的反复打磨
赛前培训
比赛前夕,校团委牵头邀请了生命与海洋科学学院实验中心陈伟钊主任、管理学院实验中心张江乐老师、医学部生物医学工程学院柴语鹃老师、医学部基础医学院汪业军老师、创新创业教育中心卓文祺老师、医学部团委副书记陶洋老师对项目进行指导,为我校取得优异成绩保驾护航。
赛前两天在参赛地会议室,校团委再次组织国赛团队进行答辩培训,从ppt呈现方式、临场表现、演讲重点等方面给予针对性的意见,并鼓励参赛团队放松心态,以自信从容的姿态迎接挑战。
团队提升
团队成员各有所长
发挥各自优势,分工明确
从校赛、省赛再到国赛
团队成员经过无数个日夜的精雕细作
一步一个脚印走向更广阔的舞台
数字细菌团队成员在相互讲解
数字细菌团队成员在进行组会
汪业军老师(左二)在对数字细菌团队进行指导
亮点展实力
创新赢未来
数字细菌项目
项目成员
项目成员:赵子毅、曹翠华、曹鑫、蔡煦霞、江祈淳、陈润鸿 、郑贻东 、章晨霞
指导老师:汪业军
核心亮点:团队成员均为医学相关专业学生,在兴趣驱动下,多数成员自学计算机编程,具有扎实编程基础,部分成员更是擅长数学和人工智能。成员背景和技术能力的多样性,促使这一生命科学和计算机的多学科交叉项目得以深度开展。
项目内容
“数字细菌”侧重于数字表征和计算,拟开发一系列工具,对细菌内在每个分子进行0/1数字编码,进而计算求解和预测细菌分子的进化、功能、相互作用、调控和表型。
细菌无处不在。作为人体的重要组成部分,它们广泛分布于人体各个部位,与人类的健康密切相关。此外,各种新发、耐药菌感染日益频发,据WHO预估,到2050年,耐药菌感染将超越肿瘤和心血管疾病,成为人类1号致死源。实现耐药菌感染的精准诊疗,是“健康中国2030”蓝图的重要组成部分。团队紧跟“十四五”规划,建设数字中国战略部署,研发全新的数字化技术,全力促进细菌的基础和临床应用研究。
本项目从基因组、分泌蛋白通路和基因水平展开研究。基因组层面,创新性将进化系统引入比较基因组研究中,直观展示基因组的进化轨迹。分泌蛋白层面,创新性提出新的特征解析及预测算法和框架,开发第一个细菌多分泌蛋白一站式集成预测和功能注释系统。基因层面,创新性开发自动地对细菌基因和基因家族进行批量、系统进化特征分析的系统。
该项目通过三个层面的原创性算法、模型及工具的开发和应用,为细菌耐药的机制研究和临床诊疗实践提供重要的指导。
创新点
基因组
首次推出一套五模块计算系统,回溯细菌古代基因组,动态展示基因组进化;
首次揭示沙门氏菌基因组变异对基因表达和染色体构象的影响
分泌通路
首个革兰阴性菌分泌蛋白一站式预测系统;
系统探查细菌分泌蛋白信号本质;分析分泌蛋白在真核细胞中亚细胞定位
基因
开发一套批量基因全自动进化分析系统;
首次发现细菌外膜蛋白镶嵌式进化机制,与细菌对抗噬菌体等不利因素相关
转化研究
开发一个基于比较基因组分析的耐药分子标记鉴定和耐药表型智能鉴别系统;
鉴定真菌/细菌多抗菌药耐药标记,自训练机器学习模型,精准预测耐药表型
取得成果
第一作者发表SCI论文3篇:
Trends Microbiol (封面论文,Cell子刊, 一区TOP,IF:18.2)
Appl Environ Microbiol (ASM经典期刊,二区TOP,IF:5.0)
Front Microbiol (二区TOP,IF:6.1)
共同第一作者论文修稿中2篇:
Genome Res (Nature指数,一区TOP,IF:9.4);
Infect Immun(美国微生物学会经典期刊,二区TOP,IF:3.1)
第一作者论文审稿中1篇 :
Brief Bioinform( IF:9.5)
软件著作权14项,申请中1项(GeneEvo)
全国荣誉:
2021年全国大学生生命科学竞赛特等奖(最高奖项)
2021年全国大学生计算机设计大赛一等奖(大数据组最高奖项)
2022年全国大学生生命科学竞赛一等奖
2023年国家级大创项目结题优秀
2023年全国大学生生命科学竞赛三等奖
2023年全国大学生基础医学实验设计大赛铜奖
应用:
开发多个应用网站和数据库,并且已被多个国内外课题组应用
漫漫征途路
更上一层楼
“在细菌研究数字化领域,
我们也将继续发挥创造力,
力争站在科技的最前线,
保持热爱,全力以赴”
希望团队不忘初心
在自己热爱的领域继续发光发热!
科创筑梦 挑战未来
祝贺团队在挑战杯国赛取得的佳绩!
供稿 | 校团委
文字 | 闻雯 朱彦澄 罗若城
图片丨潘泳瑶
编辑 | 林海音 潘泳瑶
责编 | 廖楷狄 林海音
审校 | 杨振宇 李翔 李世卓 王若琳
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